Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2 czesc 4

Uważa się, że dwukierunkowa wartość P mniejsza niż 0,05 wskazuje na istotność statystyczną. Wyniki
Charakterystyka osobników, allele ryzyka i wynik genotypu
Tabela 1. Tabela 1. Charakterystyka uczestników badania Framingham Offspring na poziomie podstawowym każdego z trzech okresów badania w analizie zbiorczej. Tabela 2. Continue reading „Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2 czesc 4”

Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2 cd

Dodaliśmy jeden SNP, rs689, w locus INS, który wcześniej uznaliśmy za powiązany z cukrzycą (P = 0,02) w badaniu Framingham Offspring Study. 23 Używając tych 18 SNP, skonstruowaliśmy wynik genotypu od 0 do 36 na podstawę liczby alleli ryzyka. Przeprowadzono genotypowanie przy użyciu iPLEX (Seąuenom) .24 Minimalna szybkość wywołania wyniosła 96,9%, średni współczynnik konsensusu z 254 duplikatów wyniósł 99,5%, a wszystkie SNP były w równowadze Hardy ego-Weinberga (P> 0,02) .25 Analiza statystyczna
Zastosowaliśmy modele mieszane, aby porównać średni wynik genotypu dla osób, u których cukrzyca rozwinęła się z wynikiem dla osób, u których cukrzyca nie rozwinęła się. Oszacowaliśmy skumulowaną częstość występowania cukrzycy poprzez podzielenie liczby osób, u których cukrzyca rozwinęła się pod koniec obserwacji w stosunku do całkowitej liczby osób zagrożonych. Wykorzystaliśmy połączone modele regresji logistycznej z uogólnionymi równaniami szacunkowymi w celu zbadania związku między wynikiem genotypu a ryzykiem rozwoju cukrzycy w ciągu 28 lat. Continue reading „Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2 cd”

Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2 ad

Po drugie, zapytaliśmy, czy informacja o genotypie może dodać do wiedzy o historii rodziny, która jest powszechnie uważana za reprezentującą ryzyko genetyczne. Na koniec zapytaliśmy, czy dodanie informacji genetycznej do informacji o czynnikach ryzyka, które są powszechnie mierzone podczas badania klinicznego w wieku dorosłym, poprawia przewidywanie ryzyka. Użyliśmy tego szkieletu do przetestowania zdolności panelu 18 polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP), o których wiadomo, że wiążą się z ryzykiem cukrzycy w przewidywaniu nowych przypadków cukrzycy typu 2 w dużej, prospektywnie przebadanej kohorcie . Metody
Próbka do badań
Badanie Framingham Heart rozpoczęło się w 1948 r. Od zapisania się 5209 osób pochodzenia europejskiego, w wieku od 28 do 62 lat, zamieszkałych w Framingham w stanie Massachusetts; uczestnicy byli następnie badani co 2 lata. Continue reading „Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2 ad”

Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2

Wiele loci genetycznych było przekonująco związanych z ryzykiem cukrzycy typu 2. Sprawdziliśmy hipotezę, że znajomość tych loci pozwala lepiej przewidywać ryzyko niż sama wiedza na temat powszechnych fenotypowych czynników ryzyka. Metody
Genotypowaliśmy polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) w 18 loci związanych z cukrzycą u 2377 uczestników badania Framingham Offspring. Stworzyliśmy wynik genotypu z liczby alleli ryzyka i zastosowaliśmy regresję logistyczną, aby wygenerować statystyki C wskazujące na stopień, w jakim wynik genotypu może dyskryminować ryzyko cukrzycy, gdy jest stosowany samodzielnie i oprócz klinicznych czynników ryzyka.
Wyniki
W ciągu 28 lat obserwacji wystąpiło 255 nowych przypadków cukrzycy. Continue reading „Ocena genotypowa oprócz wspólnych czynników ryzyka dla przewidywania cukrzycy typu 2”

Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 9

Jednak siła dyskryminacyjna samych genów była stosunkowo niewielka (0,62), ale zgodnie z ustaleniami z dwóch wcześniejszych badań.28,29 Natomiast w jednym z ostatnich badań kliniczno-kontrolnych wykazano bardzo wysoką wartość AUC 0,86 dla 15 nowych genów. loci.30 Najbardziej prawdopodobnym wyjaśnieniem jest to, że w tym badaniu osoby z cukrzycą były porównywane z tymi, którzy zachowali całkowicie normalną tolerancję glukozy. Gdybyśmy ograniczyli naszą analizę osób bez cukrzycy do osób z prawidłową tolerancją glukozy, wartość AUC zwiększyłaby się do 0,82. Dane te podkreślają zatem potrzebę badań populacyjnych do oceny ryzyka cukrzycy. Jedną z mocnych stron naszego badania był jego przyszły charakter. Continue reading „Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 9”

Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 8

Jednak dodanie danych z genotypowania znanych wariantów DNA do klinicznych czynników ryzyka (w tym wywiadu rodzinnego z cukrzycą) miało minimalny, choć statystycznie istotny, wpływ na prognozowanie przyszłej cukrzycy typu 2. Warto zauważyć, że zdolność genetycznych czynników ryzyka do przewidywania przyszłej cukrzycy typu 2 uległa poprawie wraz ze wzrostem czasu trwania obserwacji, co sugeruje, że ocena genetycznych czynników ryzyka jest klinicznie bardziej znacząca, im wcześniej w życiu są mierzone. Chociaż pacjenci w stadium przedcukrzycowym wykazywali wiele cech insulinooporności, funkcja beta-komórek dostosowana do insulinooporności (wskaźnik dyspozycyjności) była najsilniejszym predyktorem przyszłej cukrzycy. Dodanie miar wydzielania insuliny do modelu klinicznego, który obejmował głównie elementy zespołu metabolicznego, dodatkowo polepszyło moc dyskryminacyjną krzywej ROC, z 0,70 do 0,74 u osobników MPP (P = 0,001) i od 0,79 do 0,83 w osoby z Botnia (P = 0,006).
Spośród 16 loci, które wcześniej wiązały się z cukrzycą typu 2, wykazaliśmy, że 11 – TCF7L2, PPARG, FTO, KCNJ11, NOTCH2, WFS1, CDKAL1, IGF2BP2, SLC30A8, JAZF1 i HHEX – były ryzyko przyszłej cukrzycy. Continue reading „Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 8”

Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 7

Jednak osoby z wysokim ryzykiem genetycznym nie zwiększyły wydzielania insuliny (wskaźnika usposobienia), aby zrekompensować wzrost insulinooporności tak skutecznie, jak te o niskim ryzyku genetycznym (ryc. 3C i 3D). Połączony wpływ czynników ryzyka klinicznego i genetycznego
Ocenialiśmy również, czy genetyczne czynniki ryzyka jeszcze bardziej zwiększą ryzyko narzucone przez wzrost BMI lub spadek indeksu dyspozycyjności. Wystąpił skokowy wzrost ryzyka cukrzycy z rosnącą liczbą alleli ryzyka i rosnącymi kwartylami BMI (ryc. 2C) lub indeksem dyspozycyjności powyżej lub poniżej mediany. Continue reading „Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 7”

Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 6

Kombinacja wyjściowych czynników klinicznych i genetycznych przewidujących cukrzycę typu 2 w badaniach Malmö i Botni. Na podstawie rozkładu częstości alleli ryzyka określiliśmy niską genetyczną grupę ryzyka i grupę wysokiego ryzyka genetycznego jako kwintyl o najniższej (.8) i najwyższej (.12) liczbie alleli ryzyka (rysunek 1). w Dodatku Uzupełniającym). Zgodnie z oczekiwaniami więcej osób, u których zdiagnozowano cukrzycę niż osoby bez rozpoznania, miało wysokie ryzyko genetyczne (32,0% vs. 22,1%), co przełożyło się na wzrost ryzyka przyszłej cukrzycy o współczynnik 1,95 (95% przedział ufności [CI] 1,69 do 2,25; P = 2,5 x 10-20). Continue reading „Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 6”

Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 5

W najwyższym kwartylu BMI (31,8% vs. 5,1%) uzyskano iloraz szans 8,0 (95% CI, 5,71 do 11,19, P = 9,1 × 10-34). Panel D pokazuje częstość występowania cukrzycy typu 2 u nosicieli rosnącej liczby alleli ryzyka w 11 genach, które indywidualnie przewidywały przyszłe ryzyko cukrzycy typu 2 w odniesieniu do niskiego wydzielania insuliny. Nośniki o ponad 12 ryzykownych allelach i niskim wskaźniku dyspozycyjności (37,9% vs. 10,1%) miały iloraz szans 5,81 (95% CI, 3,18 do 10,61, P = 1,1 × 10-8). Continue reading „Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 ad 5”

Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 czesc 4

Wpływ wielkości genetycznego lub klinicznego czynnika ryzyka na ryzyko cukrzycy typu 2 obliczono na podstawie analizy regresji wieloczynnikowej, z uwzględnieniem wieku i płci, za pomocą kwadratu Nagelkerke R. Oceniliśmy wartość predykcyjną kombinacji alleli ryzyka (każda osoba mogła mieć 0, lub 2 z nich, łącznie 22) w 11 genach, które znacząco przewidywały ryzyko cukrzycy poprzez definiowanie przedmiotów z więcej niż 12 ryzykiem. allele (około 20%) jako osoby obarczone wysokim ryzykiem, a te z mniej niż 8 allelami ryzyka (około 20%) jako osoby niskiego ryzyka. Wszystkie analizy statystyczne przeprowadzono przy użyciu oprogramowania SPSS, wersja 14.0; PLINK (http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink); i oprogramowanie Stata. Wyniki
Zachorowalność na cukrzycę
W badaniu MPP cukrzyca rozwinęła się u 2063 pacjentów (12,8%) podczas medianowego okresu obserwacji wynoszącego 24,8 lat, z najwyższym współczynnikiem konwersji (21,1%) u pacjentów z zaburzeniami poziomu glukozy na czczo lub z upośledzoną tolerancją glukozy w punkcie wyjściowym (Figura 1A ). Continue reading „Kliniczne czynniki ryzyka, warianty DNA i rozwój cukrzycy typu 2 czesc 4”